BestCrypt vytvára a pripája zašifrované virtuálne disky. Tieto disky sú viditeľné ako normálne disky s prideleným písmenom. Dáta sú uložené v jednom zašifrovanom súbore, takže je ho možné jednoducho zálohovať alebo preniesť a naďalej ho používať. Práca s týmto šifrovaným diskom je rovnaká ako keby to bolo vynímatelné médium.